O município originou-se da povoação de Ingazeira. A localidade também já foi conhecida como Passagem dos Afogados e Vila de Afogados devido a um casal de viajantes ter perecido ao tentar atravessar o Rio Pajeú em período de cheia.
O distrito foi elevado à categoria de município em 1909, com o nome Afogados da Ingazeira.

Distrito criado com a denominação de Ingazeira, pela Lei n.º 23, de 09-06-1836, subordinado ao município de Flores.
Elevado à categoria de vila com a denominação de Afogados da Ingazeira, pela Lei Provincial n.º 295, de 05-05-1852, desmembrado de Flores. Sede na povoação de Ingazeira. Constituído do distrito sede. Instalado em 07-01-1853.
Pela Lei Provincial n.º 1.403, de 12-05-1870, é criado o distrito de Afogados da Ingazeira e anexada a vila Ingazeira.
Pela Lei Provincial n.º 1.403, de 12-05-1879, transfere a sede da vila de Ingazeira para a povoação de Afogados.
Pela Lei Provincial n.º 1.761, de 05-07-1883, a sede municipal volta a ser Ingazeira.
Elevado à condição de cidade, com a denominação de Afogados da Ingazeira, pela Lei Estadual n.º 991, de 01-07-1909.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, o município aparece constituído de 4 distritos: Afogados Ingazeira, Ingazeira, Espírito Santo, Varas.
Pela Lei Municipal n.º 22, de 25-11-1916, é criado o distrito de Macacos e anexado ao município de Afogados da Ingazeira.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, o município e aparece constituído de 5 distritos: Afogados da Ingazeira, Espírito Santo, Jangada, Macacos e Varas.
Em divisão territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937 o município aparece constituído de 7 distritos: Afogados da Ingazeira, Espírito Santo, Jangada, Macacos, Varas, Bom Jesus e Solidão.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 92, de 31-03-1938, o distrito de Espírito Santo tomou o denominar-se Tabira.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 235, de 09-12-1938, o distrito de Bom Jesus tomou o nome de Tupã o distrito de Varas a chamar-se Jabitacá.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o município é constituído de 6 distritos: Afogados da Ingazeira, Jabitacá (ex-Varas), Macacos, Solidão, Tabira (ex-Espírito Santo) e Tupã (ex-Bom Jesus).
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 952, de 31-12-1943, o distrito de Tupã passou a denominar-se Tuparetama.
Pela Lei Estadual n.º 421, de 31-12-1948, o distrito de Macacos passou a denominar-se Iguaraci.
Pela Lei Estadual n.º 418, de 31-12-1948, desmembra do município de Afogados da Ingazeira os distritos de Tabira, Solidão e Tuparetama, para Constituir o novo município de Tabira.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1955, o município é constituído de 3 distritos: Afogados da Ingazeira, Iguaraci (ex-Macacos) e Jabitacá.
Pela Lei Municipal n.º 84, de 30-01-1958, é criado o distrito de Irajaí e anexado ao município de Afogados da Ingazeira.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído de 4 distritos: Afogados da Ingazeira, Iguaraci, Irajaí e Jabitacá.
Pela Lei Estadual n.º 4.954, de 20-12-1963, desmembra os municípios de Afogados da Ingazeira os distritos de Iguaraci, Irajaí e Jabaticá., para constituir o novo município de Iguaraci.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2015.