Historicamente, data de 1925 a origem da Vila onde hoje se localiza o município de Águia Branca.
A fertilidade da terra e a abundância de madeira deram grande impulso ao desenvolvimento da região, mais tarde colonizada por poloneses.
A origem do nome Águia Branca, se deve ao símbolo que a bandeira polonesa apresenta com uma águia em destaque.

Distrito criado com a denominação de Águia Branca, pela Lei Estadual n.º 265, de 22-10-1949, com território desmembra do distrito de Alto Rio Novo, subordinado ao município de Colatina.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o distrito de Águia Branca figura no município de Colatina.
Pela Lei n.º 777, de 29-12-1953, é transferido o distrito de Águia Branca do município de Colatina para o de São Domingos.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1955, o distrito de Águia Branca figura no município de São Domingos.
Por decisão do Supremo Tribunal Federal – Acordão de 14-10-1955, foi anulado o Ato de criação do município de São Domingos, voltando o distrito de Águia Branca a pertencer ao município de Colatina.
Em divisão territorial datada 1-VII-1960, o distrito de Águia Branca permanece no município de Colatina.
Pela Lei Estadual n.º 1.837, de 21-02-1963, é desmembrado do município de Colatina o distrito de Águia Branca, para formar o novo município de São Gabriel da Palha (ex-São Gabriel).
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o distrito de Águia Branca figura no município de São Gabriel da Palha.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-I-1979.
Elevado à categoria de município com a denominação de Águia Branca, pela Lei Estadual n.º 4.070, de 11-05-1988, desmembrado do município de São Gabriel da Palha. Sede no antigo distrito de Águia Branca. Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1989.
Em divisão territorial datada de 1993, o município é constituído de distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VI-1995.
Em divisão territorial datada de 2007, o município é constituído de 2 distritos: Águia Branca e Águas Claras.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2017.