Coube ao Capitão Simplício de Holanda Bezerra, fazendeiro e proprietário de terras no reduto e áreas circunjantes a iniciativa de construir uma capela (1866), tendo como objeto de inspiração religiosa o Menino Deus. A Paróquia, vinculada ao Bispado de Limoeiro do Norte, instituiu-se a 20 de Setembro de 1921, sob a invocação do Pequeno Grande, tendo como primeiro vigário o padre Francisco de Assis Castro Monteiro. Existem sob a jurisdição paroquial dois templos, sendo um dedicado ao Menino Deus e outro a Nossa Senhora de Lourdes.

Distrito criado com a denominação de Alto Santo da Viúva, pelo Ato Provincial de 24-03-1871, subordinado ao município de Limoeiro.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, o distrito de Alto Santo da Viúva figura no município de Limoeiro.
Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Pelo Decreto Estadual n.º 378, de 20-10-1938, o distrito de Alto Santo da Viúva passou a denominar-se simplesmente Alto Santo.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 1.114, de 30-12-1943, o município de Limoeiro passou a denominar-se Limoeiro do Norte.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o distrito já denominado Alto Santo figura no município de Limoeiro do Norte ex-Limoeiro.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1955.
Elevado à categoria de município com a denominação de Alto Santo, pela Lei Estadual n.º 3.814, de 13-09-1957, desmembrado de Limoeiro do Norte. Sede no antigo distrito de Alto Santo. Constituído de 2 distritos: Alto Santo e Castanhão. Instalado em 01-06-1958.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído de 2 distritos: Alto Santo e Castanhão.
Pela Lei Estadual nº 6.654, de 14-10-1963, é desmembrado do município Alto Santo o distrito de Castanhão. Elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído do distrito sede.
Pela Lei Estadual n.º 8.339, de 14-12-1965, Alto Santo adquiriu o território do extinto município de Castanhão.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1968, o município é constituído de 2 distritos: Alto Santo e Castanhão.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2007.