Desde 1867 a região onde se ergue a Sede Municipal começou a ser povoada, registrando-se como primeiro morador Máximo Libório da Paixão. No ano seguinte, estabeleceu-se no local Vicente Bernadino Gomes, o fundador da povoação.
O lugarejo foi reconhecido como povoação pela Lei Provincial nº 691, 1872, com o nome de São Vicente do Araguaia, em homenegem a São Vicente Ferrer, o Padroeiro da localidade e ao rio Araguaia, que banha a região.
Começava a vida religiosa em 1878, sob a orientação de Frei Salvino de Remini e, até o final do século XIX a povoação experimentou o declínio decorrente da revolução política em Tocantinópolis, retornando à marcha progressiva em 1900. Houve, em seguida, novo período revolucionário, que durou mais uma década.
Em 1913, pela Lei Estadual nº 426, de 21 de junho, o povoado foi elevado a Município, com o topônimo de São Vicente. A instalação não se efetivou, permanecendo embrionário até 7 de setembro de 1931, quando, pelo Decreto nº 1.224, de 7 de junho, foi instalado oficialmente.
No mesmo ano ocorreu a visita da Família Imperial (D. Pedro de Orleans, D. Pedro Gastão e Princesa Dona Francisca), em viagem pelo interior do Brasil. Em 1945, o Decreto-Lei Federal nº 7.655, de 18 de junho, determinou a transferência da Sede do Município para o distrito de Itaguatins, efetivada pelo Decreto Estadual nº 550, de 19 de julho do mesmo ano.
Pelo Decreto-Lei Estadual nº8.305, de 31 de dezembro, São Vicente passou a denominar-se Araguatins, combinação decorrente de Araguaia e Tocantins, os dois grandes rios que fazem confluência na região. Perdeu sua autonomia administrativa municipal, restabelecida em 13 de outubro de 1948, pela Lei Estadual nº 184. Instalado oficialmente em 1º de janeiro de 1949, ingressou num período de expressivo progresso.