Os municípios da região de Bom Jardim tiveram a colonização influenciada por descendentes de alemães (Brust, Emerich, Erthal, Heckert, Miller, Shott), suíços (Ballonecker, Marchon, Bohrer, Marfurt, Bercot, Monnerat), franceses, portugueses e libaneses. A ocupação das terras do atual município de Bom Jardim está diretamente ligada à ocupação das terras auríferas de Cantagalo. Nos finais do século XVIII e no início do século XIX a Coroa Portuguesa passou a distribuir cartas de sesmarias na região a fim de promover a sua ocupação.
Várias sesmarias foram solicitadas nas margens do Rio Grande onde hoje se localiza o município de Bom Jardim. Em 1819, já com a família Real do Brasil, foi instalada uma colônia suíça a apenas 4 léguas da atual sede do município. Em 1824 uma colônia de alemães instalou-se no mesmo local. Muitos desses colonos estabeleceram-se em terras pertencentes ao atual município de Bom Jardim.
Com o desenvolvimento da lavoura cafeeira na província fluminense, Cantagalo tornou-se um grande polo produtor e Bom Jardim beneficiou-se como rota de trânsito das tropas que transportavam o café para o Rio de Janeiro e, também passou a ser produtor de café. A autonomia do município de Bom Jardim começou a ser delineada em 1857, quando a localidade de São José do Ribeirão (hoje 2º distrito de Bom Jardim), foi elevada à categoria de freguesia do município de Nova Friburgo.
Em 1875 foi inaugurado o ramal ferroviário até Bom Jardim. Em torno da estação desenvolveu-se um povoado que em 1886 foi elevado à categoria de distrito policial do município de Cantagalo.

Freguesia criada com a denominação de São José do Ribeirão, pela Lei Provincial n.º 519, de 04-05-1850 e pela deliberação de 21-11-1887 e por Decreto Estadual n.º 280 de 06-07-1890.
Elevado à categoria de vila com a denominação de Bom Jardim, por Decreto Estadual n.º 280, de 06-07-1891, desmembrado dos municípios Nova Friburgo e Cantagalo. Sede na povoação de São José do Ribeirão.
Pelo Decreto Estadual n.º 1, de 08-05-1892 a Vila de São José do Ribeirão foi extinta, sendo seu território anexado ao município de Nova Friburgo, retificado pelo Decreto Estadual n.º 1-A, de 03-06-1892.
Elevado novamente à categoria de vila com a denominação de Bom Jardim, pela Lei Estadual n.º 37, de 17-12-1892, desmembrado de Friburgo e Cantagalo. Sede na antiga povoação de Bom Jardim. Constituído de 2 distritos: Bom Jardim e São José do Ribeirão. Ambos desmembrado de Nova Friburgo. Instalado 06-03-1893.
Pela Lei Estadual n.º 234, de 21-09-1906, é criado o distrito de Barra Alegre (ex-povoado) e anexado à vila de Bom Jardim.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, a vila de Bom Jardim é constituída de 3 distritos: Bom Jardim, São José do Ribeirão e Barra Alegre.
Pela Lei Estadual n.º 1.913, de 29-12-1924, é criado o distrito de Banquete e anexado à vila de Bom Jardim.
Elevado à condição de cidade com a denominação de Bom Jardim, pela Lei Estadual n.º 2.335, de 27-12- 1929.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, o município se constituído de 4 distritos: Bom Jardim, São José do Ribeirão, Barra Alegre e Banquete.
Assim permanecendo nas divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 641, de 15-12-1938, o distrito de São José do Ribeirão passou a denominar-se simplesmente Ribeirão.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o município é constituído de 4 distritos: Bom Jardim, Barra Alegre, Banquete e Ribeirão (ex-São José do Ribeirão).
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 1.056, de 31-12-1943, o município de Bom Jardim passou a denominar-se Vergel e o distrito de Ribeirão a denominar-se Paraim.
Pelas Disposições Transitórias da Constituição do Estado do Rio de Janeiro, promulgada a 20-06- 1947, vieram modificar o topônimo do município Vergel para sua antiga denominação de Bom Jardim.
No quadro fixado para vigorar no período de 1944-1948, o município é constituído de 4 distritos: Bom Jardim (ex-Vergel), Barra Alegre, Banquete e Ribeirão.
Pelo Decreto Estadual n.º 16, de 12-10-1949, o distrito de Paraim teve seu topônimo alterado para São José do Ribeirão.
Em divisão territorial datada de I-VII-1960, o município é constituído de 4 distritos: Bom Jardim, Banquete, Barra Alegre e São José do Ribeirão (ex-Paraim).
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2019.