Em 1870, deu-se início à povoação do atual território de Guanambi, às margens do rio Carnaíba de Dentro, com a doação de uma parte da fazenda Carnaíba, feita pelo seu proprietário Joaquim Dias Guimarães à freguesia criada nesse mesmo ano sob a invocação de Santo Antônio, e subordinada à paróquia de Monte Alto, em cujo local foi erguida a primeira igreja, tomando o lugar o nome de Beija-Flor.
A partir dessa data foi crescendo a população da nova freguesia, constituída, inicialmente, das famílias de João Pereira da Costa, José Pereira da Silva Castro, Gasparino Pereira da Costa, João Dias Guimarães, Inocêncio Pereira de Oliveira e muitos outros, que intensificaram a exploração da agricultura e da pecuária na Região.

Distrito criado com a denominação de Guanambi pela Lei Provincial n.º 1.979, de 23-06-1880, e pela Lei Municipal n.º 2, de 08-01-1920, estando subordinado ao município de Monte Alto.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911 o distrito de Guanambi figura no município de Monte Alto.
Elevado à categoria de vila com a denominação de Guanambi pela Lei Estadual n.º 1.364, de 14-08-1919, sendo desmembrado de Monte Alto. Sede na antiga povoação de Bela Flor. Constituído do distrito sede. Instalada em 01-01-1920.
Pela Lei Municipal n.º 2, de 08-01-1920, e pelas Leis Estaduais n.º 1.589, de 22-08-1922, e n.º 2.219, de 20-08-1929, é criado o distrito de Mucambo e anexado ao município de Guanambi.
Pela Lei Estadual n.º 2.133, de 09-08-1929, é criado o distrito de Itaguassu e anexado ao município de Guanambi. Pela mesma Lei Estadual acima citada Guanambi adquiriu do município de Urandi o distrito de Gentio.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933 o município é constituído de 4 distritos: Guanambi, Gentio, Mucambo e Itaguassu. Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Pelo Decreto Estadual n.º 11.089, de 30-11-1938, o distrito de Gentio tomou a denominação de Ceraíma.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939 a 1943 o município é constituído de 4 distritos: Guanambi, Ceraíma, Mucambo e Itaguassu.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 141, de 31-12-1943, confirmado pelo Decreto Estadual n.º 12.978, de 01-06-1944, o distrito de Itaguassu tomou a denominação de Mutans e Mucambo passou a chamar-se Candiba.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950 o município é constituído de 4 distritos: Guanambi, Candiba, Ceraíma, Mucambo e Mutans.
Pela Lei Estadual n.º 628, de 30-12-1953, o distrito de Mutans passou a grafar Mutãs.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1955 o município é constituído de 4 distritos: Guanambi, Candiba, Ceraíma, Mucambo e Mutãs. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1960.
A Lei Estadual n.º 1.756, de 27-07-1962, desmembra do município de Guanambi o distrito de Candiba, elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963 o município é constituído de 3 distritos: Guanambi, Ceraíma e Mutãs. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2003.
Pela Lei Municipal n.º 20, de 15-03-2005, é criado o distrito de Morrinhos e anexado ao município de Guanambi.
Em divisão territorial datada de 2003, o município é constituído de 4 distritos: Guanambi, Ceraíma, Morrinhos e Mutãs. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2014.