Tem-se notícias de que por volta do ano de 1748, Iporá teve sua origem com a formação do arraial de Pilões, na margem do Rio Claro. E que no ano de 1749, com a vinda de Gomes Freire de Andrade, Governador das Capitanias de Minas Gerais e Rio de Janeiro, se firmaram contratos de exploração dos diamantes de Rio Claro e Rio Pilões. Para essas atividades iniciais de garimpo, vieram duzentos escravos que trabalhavam sob o comando dos exploradores contratados. Forças do exército, enviadas pela Coroa, garantiam a execução do serviço. O povoado nascente recebeu o nome de Rio Claro (dado ao rio caudaloso em que se procedia à cata dos diamantes).
A expressiva produção de diamantes e o desenvolvimento rápido do arraial motivaram o extraordinário crescimento. Assim, em 5 de julho de 1833, Rio Claro passou à categoria de distrito, mantendo-se a denominação de Rio Claro, pertencente ao Município de Goiás, antiga Vila Boa. Alterando o nome da Igreja que era do Senhor do Bom Fim para paróquia Nossa Senhora do Rosário. O distrito permaneceu com o mesmo nome, até que o povoado caiu em decadência e para agravar a situação, a população foi acometida de um surto de febre amarela, matando e afugentando a maioria dos moradores do lugar. E então, o povoado que, em seus tempos de glória, chegou a contar com cerca de mil habitantes, ficou reduzido a poucas famílias e alguns descendentes de escravos, tendo sido chamado carinhosamente de “Comércio Velho”. Sendo que na década de 30, do século XX, conjecturou-se entre os daquele lugar a mudança do povoado. Formou-se uma comissão que escolheu o lugar às margens do Córrego Tamanduá, onde é a sede atual do município, para abrigar a nova povoação.
Em 1938, o Distrito de Rio Claro passou a denominar-se Itajubá, topônimo de origem indígena, tupi-guarani, que significa pedra amarela. Em 1942, Joaquim Paes Toledo e família doaram uma área de 100 alqueires goianos de terras para a edificação da cidade.
O topônimo Iporá é de origem indígena, que significa águas claras.

Distrito criado com a denominação de Rio Claro, pelo Decreto de 05-07-1833, subordinado ao município de Goiás.
Em divisão Administrativa referente ao ano de 1911, o distrito figura no município de Goiás.
Assim permanecendo em divisões territoriais de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 1.233, de 31-10-1938, o distrito de Rio Claro passou a denominar-se Itajubá.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o distrito de Itajubá (ex-Rio Claro) figura no município de Goiás.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 8.305, de 31-12-1943, o distrito de Itajubá passou a denominar-se Iporá.
No quadro fixado para vigorar no período de 1944-1948, o distrito de Iporá (ex-Itajubá) permanece no município de Goiás.
Elevado à categoria de município com a denominação de Iporá, pela Lei Estadual n.º 249, de 19-11-1948, desmembrado de Goiás. Sede no antigo distrito de Iporá. Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1949.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o município de Iporá, é constituído do distrito sede.
Pela Lei Municipal n.º 53, de 19-09-1953, é criado o distrito de Campo Limpo e anexado ao município de Iporá.
Pela Lei Municipal n.º 54, de 19-09-1953, é criado o distrito de Monchão do Vaz e anexado ao município de Iporá.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1955, o município é constituído de 3 distritos: Iporá, Campo Limpo e Monchão de Vaz.
Pela Lei Estadual n.º 2.093, de 14-11-1958, é desmembrado do município de Iporá, o distrito de Campo Limpo. Elevado à categoria de município com a denominação de Amorinópolis.
Pela Lei Estadual n.º 2.114, de 14-11-1958, é desmembrado do município de Iporá o distrito de Monchão do Vaz. Elevado à categoria de município de Israelândia.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2018.