A comunidade teve início em 1755, com a denominação de Aldeia de São José, fundada para servir de habitação dos índios Akroás e Naundós.
Em 1774 foi reerguida com edificações pelo então Governador da Capitania de Goiás e Capitão-General, D. José de Almeida Vasconcelos Several de Carvalho, Barão de Mossâmedes para sua residência e local de escravização dos índios KAIAPÓS. Com isto, passou a denominar-se Aldeia de São José de Mossâmedes.
Os índios trabalhavam e eram catequizados por Damiana da Cunha, que sendo índia, conseguia atraí-los para a aldeia. Ali, eles eram submetidos a uma vida estranha a sua natureza de habitantes das matas. Eram obrigados a realizar o trabalho dos brancos e a se adaptar ao meio deles numa convivência que não os agradava.
Em1º de setembro de 1780, o Bispo do Rio de Janeiro, D. José Joaquim Justiniano Mascarenha Castelo Branco, sob cuja jurisdição estava a Capitania de Goiás, criou a Freguesia de São José de Mossâmedes, desligando-a da vizinha Cidade de Goiás.

Distrito criado com a denominação de São José de Mossâmedes, pela Lei Provincial n.º 6, de 31-07-1845, subordinado ao município de Goiás.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, o distrito figura no município de Goiás.
Assim permanecendo em divisões territoriais datada de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 557, de 30-03-1938, o distrito de São José de Mossâmedes, passou a denominar-se simplesmente Mossâmedes.
No quadro fixado para vigorar no período de 1944-1948, o distrito permanece no município de Goiás.
Elevado à categoria de município com a denominação de Mossâmedes, pela Lei Estadual n.º 772, de 14-11-1952, desmembrado de Goiás. Sede no antigo distrito de Mossâmedes. Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1954.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1955, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1960.
Pela Lei Municipal n.º 118, de 10-05-1963, é criado o distrito de Adelândia e anexado ao município de Mossâmedes.
Pela Lei Municipal n.º 119, de 02-12-1962 é criado o distrito de Buriti e anexado ao município de Mossâmedes.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído de 3 distritos: Mossâmedes, Adelândia e Buriti.
Pela Lei Municipal n.º 173, de 11-02-1966, o distrito de Buriti passou a denominar-se Campo das Perdizes.
Pela Lei Estadual n.º 10.396, de 30-12-1987, é desmembrado do município de Mossâmedes o distrito de Adelândia. Elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 18-VIII-1988, o município é constituído de 2 distritos: Mossâmedes e Campo das Perdizes.
Pela Lei Estadual n.º 11.702, de 29-04-1992, é desmembrado do município de Mossâmedes o distrito de Campo das Perdizes. Elevado à categoria de município com a denominação de Buriti de Goiás.
Em divisão territorial datada de 2003, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2018.