Pilar de Goiás nasceu em 1736 através da iniciativa de um reduto de escravos foragidos que encontraram neste lugar um abrigo, e também uma grande fonte de ouro.
Para recuperar estes escravos incumbiram desta missão o bandeirante João de Godoy Pinto Silveira. Sem saber com o que iria se deparar, o bravo partiu em meio ao cerrado (vegetação local) a procura destes escravos e quando os encontrou eles já haviam garimpado uma quantidade razoável de ouro e ofereceram este ouro em troca da liberdade.
Neste momento começava a povoação em grande escala daquela área que até então era chamada pelos quilombolas de Quilombo de Papuã.
Com o início da exploração do ouro muitas pessoas vieram de diversas partes na busca pelo metal dourado.

Distrito criado com a denominação de Pilar, por Alvará de 10-01-1755, no município de Goiás.
Elevado à categoria de vila com a denominação de Pilar, pelo Decreto de 11-11-1831, desmembrado de Goiás. Constituído de 2 distrito: Pilar e Crixás. Instalado em 07-01-1833.
Pela Lei Provincial n.º 14, de 23-07-1835, é criado o distrito de Amaro Leite e anexado ao município de Pilar.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, o município aparece constituído de 4 distritos: Pilar, Amaro Leite, Crixás e Descoberto.
Pela Lei Municipal n.º 1, de 04-01-1924, é criado o distrito de Santana e anexado ao município de Pilar.
Pelo Decreto Estadual n.º 1.204, de 04-07-1931, é desmembrado do município de Pilar os distritos de Santana, Amaro Leite e Descoberto para formar o novo município de Santana.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, o município aparece constituído de 2 distritos: Pilar e Crixás.
Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Pelo Decreto Estadual n.º 627, de 21-01-1931, é desmembrado do município de Morrinhos o distrito de Bananeiras. Elevado à categoria de município.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 1.233, de 31-10-1938, é criado o distrito de Floresta com terras desmembradas do distrito de Crixás e anexado ao município de Pilar.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o município é constituído de 3 distritos: Pilar, Crixás e Floresta.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 8.305, de 31-12-1943, o município de Pilar passou a denominar-se Itacê. Pelo mesmo Decreto é criado o distrito de Embiara e anexado ao município de Itacê. E, ainda pelo referido Decreto, Itacê adquiriu do município de Goiás o distrito de Bandeirantes e o distrito de Floresta passou a chamar-se Itapaci.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 55, de 19-07-1945, o município de Itacê é conduzido categoria de distrito. Pelo mesmo Decreto o distrito de Itapaci é elevado à categoria de município.
No quadro fixado para vigorar no período de 1944-1948, Itacê figura como distrito no município de Itapaci.
Pela Lei Estadual n.º 355, de 30-11-1949, o distrito de Itacê passou a denominar-se Pilar de Goiás.
Em divisão territorial vigente em 1-VII-1950, o distrito de Pilar de Goiás (ex-Itacê) figura no município de Itapaci.
Elevado à categoria de município com a denominação de Pilar de Goiás, pela Lei Estadual n.º 790, de 05-10-1953, desmembrado de Itapaci. Sede no antigo distrito de Pilar de Goiás. Constituído de 3 distritos: Pilar de Goiás, Bandeirante e Crixás, todos desmembrado de Itapaci. Reinstalado em 01-01-1954.
Pela Lei Estadual n.º 850, de 30-10-1953, são transferidos do município de Pilar de Goiás os distritos de Crixás e Bandeirante para o novo município de Crixás.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1955, o município é constituído do distrito sede.
Pela Lei Municipal n.º 29, de 26-06-1958, é criado o distrito de Hidrolina (ex-povoado de Lobeira) e anexado ao município de Pilar Goiás.
Pela Lei Estadual n.º 2.131, de 14-11-1958, é desmembrado do município de Pilar de Goiás o distrito de Hidrolina. Elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído do distrito sede.
Pela Lei Municipal n.º 19, de 22-07-1963, é criado o distrito de Santa Terezinha de Goiás e anexado ao município de Pilar de Goiás.
Pela Lei Estadual n.º 4.705, de 23-10-1963, é desmembrado do município de Pilar o distrito de Santa Terezinha de Goiás. Elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2017.