Não se sabe ao certo, quais foram os primeiros habitantes de Presidente Kubitschek, mas sabe-se que na época do Brasil Colônia os escravos Africanos mineravam em nossos rios e campos, sabendo-se também que neste município moravam índios, os quais deram à localidade o nome de Ocapoã e depois Ivituruí.
Nos tempos remotos, os tropeiros faziam suas viagens, vindos da Região da Mata (Serro, Sabinópolis, Guanhães, Rio Vermelho, etc.), transportavam as mercadorias, assim como: toucinho, carne, cereais, indo até Curvelo, Estação do Barão de Guaicuí e demais localidades.
Esses tropeiros mercadores, aqui faziam pouso. Como era mais comum descançar em um lugar alto denominado Capoeira Grande, deram-no o nome de Pouso Alto.
Pouso Alto passou a ser distrito de Diamantina por Lei n° 1295 de 30/10/1866 e elevado à Paroquia por Lei n° 442 de 28/12/1887. Mas em Minas Gerais havia uma cidade com esse mesmo nome, e então mudaram para Tijucal por Lei n° 843 de 07/09/1923.
Emancipação
O distrito começou a crescer e se evoluir, o povo sentiu a necessidade de ser independente, surgindo assim a idéia de emancipação.
Muitas pessoas contribuíram. Dentre eles destacamos: Dr. Valdir de Avila, Dep. Dr. Sady da Cunha, João Nunes de Souza.
Juntamente com a idéia de emancipação surgiu também a idéia de mudança de nome de Tijucal para Presidente Kubitschek, em homenagem a Juscelino Kubitschek de Oliveira.

Distrito criado com a denominação de Pouso Alto, pela Lei Provincial n.º 3.442, de 28-09-1887 e Lei Estadual n.º 2, de 14-09-1891, subordinado ao município de Diamantina.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, o distrito de Pouso Alto figura no município de Diamantina.
Assim permanecendo nos quadros de apuração do Recenseamento Geral de 1-IX-1920.
Pela Lei Estadual n.º 843, de 07-09-1923, o distrito de Pouso Alto tomou o nome de Tijucal.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, o distrito de Tijucal (ex-Pouso Alto), figura no município de Diamantina.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1960.
Elevado à categoria de município com a denominação de Presidente Kubiteschek, pela Lei Estadual n.º 2.764, de 30-12-1962, desmembrado de Diamantina. Sede no Atual distrito de Presidente Kubitschek (ex-Tijucal). Constituído do distrito sede. Instalado em 01-03-1963.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2020.