A origem do povoamento desta região foi a fazenda Passa Três, adquirida pela família Fernandes de Carvalho em 1910. A localidade estava situada no interior do município de Pilar de Goiás, à margem da estrada real, passagem obrigatória de tropeiros e comerciantes procedentes do sul.
Por sua localização, o local atraiu rapidamente numerosas famílias das regiões vizinhas, e em 1913, o Cel. Gaspar iniciou a construção da Capela de Sant’Ana e doou-lhe área de terras para formação do povoado que também denominou-se Sant’Ana, em homenagem à Santa de devoção da família do fundador.
A inauguração da Capela deu-se em 1922 e, dois anos depois, o povoado de Sant’Ana adquiriu categoria de Distrito. Instalando-se no mesmo ano. Em 1931 Sant’Ana alcançou emancipação político-administrativa e, a partir de 1943, recebeu denominação de Uruaçu, que em tupi-guarani significa pássaro grande.
Nos últimos anos da década em 1950 Uruaçu teve desenvolvimento em todos os setores, em consequência da inauguração da Rodovia Belém-Brasília (BR-153), em cujas margens a cidade está localizada.

Distrito criado com a denominação de Santana, pela Lei Municipal n.º 1, de 04-01-1924, subordinado ao município de Pilar.
No quadro geral do Recenseamento de 1-IX-1920, o distrito de Santana figura no município de Pilar.
Elevado à categoria de município com a denominação de Santana, pelo Decreto Estadual n.º 1.204, de 04-07-1931, desmembrado de Pilar. Sede no antigo distrito de Santana. Constituído de 3 distritos: Santana, Amaro Leite e Descoberto, todos desmembrados de Pilar. Instalado em 03-09-1931.
Em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937, o município é constituído de 3 distritos: Santana, Amaro Leite e Descoberto.
Pelo Decreto-lei Estadual n.º 8.305, de 31-12-1943, o município de Santana passou a denominar-se Uruaçu, sob o mesmo Decreto o distrito de Descoberto passou a denomina-se Porangatu.
No quadro fixado para vigorar no período de 1944-1948, o município de Uruaçu é constituído de 3 distritos: Uruaçu (ex-Santana), Amaro Leite e Porangatu (ex-Descoberto).
Pela Lei Estadual n.º 122, de 25-08-1948, é desmembrado do município de Uruaçu o distrito de Porangatu. Elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o município é constituído de 2 distritos: Uruaçu e Amaro Leite.
Pela Lei Estadual n.º 760, de 26-08-1953, é desmembrado do município de Uruaçu o distrito de Amaro Leite. Elevado à categoria de município.
Pela Lei Municipal n.º 9, de 20-12-1958, é criado o distrito de Geriaçu e anexado ao município de Uruaçu.
Em divisão territorial datada de 1-VI-1960, o município é constituído de 2 distritos: Uruaçu e Geriaçu.
Pela Lei Municipal n.º 77, de 31-01-1963, é criado o distrito de Campinaçu e anexado ao município de Uruaçu.
Em divisão territorial datada de 31-XII-1963, o município é constituído de 3 distritos: Uruaçu, Campinaçu e Geriaçu.
Pela Lei Estadual n.º 8.027, de 01-12-1975, é criado o distrito de Minaçu e anexado ao município de Uruaçu.
Pela Lei Estadual n.º 8.025, de 14-05-1976, é desmembrado do município de Uruaçu o distrito de Minaçu. Elevado á categoria de município.
Pela Lei Estadual n.º 8.093, de 14-05-1976 é criado o distrito de Pau-Terra e anexado ao município de Uruaçu.
Em divisão territorial datada de 1-I-1979, o município é constituído de 4 distritos: Uruaçu, Campinaçu, Geriaçu e Pau-Terra.
Pela Lei Estadual n.º 9.177, de 14-05-1982, é desmembrado do município de Uruaçu o distrito de Campinaçu. Elevado à categoria de município.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1983, o município é constituído de 3 distritos: Uruaçu, Geriaçu e Pau-Terra.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2017.